2025年成立海洋经济研究院，挂靠环境与生物工程学院。整合环境与生物工程学院、土木工程学院、药学与医学技术学院、智能制造学院等相关科研力量，组建跨学科团队。研究院聚焦莆田市海洋经济发展需求，开展水产育种、养殖与加工利用，海洋及海岸带生态环境保护与治理，海洋生物提取与高值化利用，海洋养殖海域规划与管理，海洋装备与智慧海洋技术研究，并发挥智库功能，为海洋产业发展提供决策咨询，推进产学研合作与社会服务。