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曲啸洋
一、个人简介
曲啸洋，药学与医学技术学院副教授，硕士生导师；厦门大学博士毕业，福建省C类人才，莆田市高层次人才；共发表Nature Catalysis、JCTC、JCIM等高水平SCI论文10余篇。研究兴趣：1.开发基于物理和AI的药物设计方法（预测蛋白质-配体相互作用的打分函数、分子生成模型），用于分子对接和虚拟筛选；2. 利用人工智能设计和改造金属酶，实现重要药物中间体以及化学品中间体的生物合成。
联系方式：xiaoyangqu@ptu.edu.cn
二、科研项目
研究项目
1. 国家自然科学基金委员会, 青年科学基金项目，22503048，人工智能和催化机理驱动改造P450酶调控甾体选择性羟基化，2026-01-01至 2028-12-31, 30万元, 在研, 主持
2. 福建省科学技术厅，面上项目，2025J01385，基于水分子介导作用的药物设计及智能平台构建，2025-09-01至 2028-08-31, 10万元, 在研, 主持
3. 福建省教育厅, 福建省中青年教师教育科研项目, JZ240053, 嵌入微观相互作用机制的智能药物设计方法研究, 2025-01 至 2027-12, 10万元, 在研, 主持
三、科研成果
论文著作
1. Ding Luo; Xiaoyang Qu; Dexin Lu; Yiqiu Wang; Lina Dong; Binju Wang*, Ligand-Conditioned Side Chain Packing for Flexible Molecular Docking. J. Chem. Theory Comput. 2025, 21(3), 1494-1505.
2. Ding Luo; Huining Ji+; Baodong Hu+; Jinxing Cai+; Kaiqi Wen; Xiaoyang Qu; Mingfeng Cao; Xinrui Zhao*; Binju Wang*, A Multimodal Ensemble Framework for Optimal Mutant Prediction and Computational Enzyme Engineering. Angew.Chem.Int.Ed. 2025, e21396.
3. Xiaoyang Qu; Lina Dong; Ding Luo; Yubing Si; Binju Wang*, Water Network-Augmented Two-State Model for Protein−Ligand Binding Affinity Prediction. J. Chem. Inf. Model. 2024, 64(7): 2263–2274.
4. Xiaoyang Qu; Lina Dong; Yubing Si; Yuan Zhao; Qiantao Wang*; Peifeng Su; Binju Wang*, Reliable Prediction of the Protein-Ligand Binding Affinity Using a Charge Penetration Corrected AMOEBA Force Field: A Case Study of Drug Resistance Mutations in Abl Kinase. J. Chem. Theory Comput. 2022, 18 (3), 1692–1700.
5. Xiaoyang Qu; Lina Dong; Jinyan Zhang; Yubing Si; Binju Wang*, Systematic Improvement of the Performance of Machine Learning Scoring Functions by Incorporating Features of Protein-Bound Water Molecules. J. Chem. Inf. Model. 2022, 62 (18), 4369–4379.
6. Wei Peng; Xiaoyang Qu; Sason Shaik*; Binju Wang*, Deciphering the Oxygen Activation Mechanism at the CuC Site of Particulate Methane Monooxygenase. Nat. Catal. 2021, 4 (4), 266–273.
7. Tianyong Liu; Xiaoyang Qu; Yuqin Zhang; Xiaohang Wang; Qian Dang; Xingxing Li; Binju Wang; Shaobin Tang*; Yi Luo; Jun Jiang*, Regulating the charge densities of s-Block calcium single-atom site catalysts for efficient N2 activation and reduction. Chem. Eng. J. 2023, 457, 141187.
8. Ding Luo; Dandan Liu; Xiaoyang Qu; Lina Dong; Binju Wang*, Enhancing Generalizability in Protein−Ligand Binding Affinity Prediction with Multimodal Contrastive Learning. J. Chem. Inf. Model. 2024, 64(6): 1892–1906.
9. Lina Dong; Shuai Shi; Xiaoyang Qu; Ding Luo; Binju Wang*, Ligand binding affinity prediction with fusion of graph neural networks and 3D structure-based complex graph. Phys. Chem. Chem. Phys. 2023, 25, 24110-24120.
10. Dong Lina; Qu Xiaoyang; Zhao Yuan; Wang Binju Prediction of Binding Free Energy of Protein–Ligand Complexes with a Hybrid Molecular Mechanics/Generalized Born Surface Area and Machine Learning Method. ACS Omega 2021, 6 (48), 32938–32947.
11. Dong Lina; Qu Xiaoyang; Wang Binju XLPFE: A Simple and Effective Machine Learning Scoring Function for Protein–Ligand Scoring and Ranking. ACS Omega 2022, 7 (25), 21727–21735.
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