肿瘤病理学与基因诊断：应用实验病理学、分子病理学、基因芯片、转录组学、蛋白质组学及生物信息学等技术，揭示肿瘤病理学新进展，探索基因突变检测、基因融合检测、甲基化、杂合性缺失情况、肿瘤耐药、基因多态性及分子标志物检测等在病理诊断及基因诊断中的作用。

肿瘤发生发展与复发转移的生物学机制：主要探索肿瘤微环境、肿瘤与间质交互作用、免疫微环境调控等在肿瘤发生发展与复发转移中的作用及相关机制；探索癌基因、抑癌基因及外源性生物活性物质等在肿瘤复发与转移中的作用及其分子机制研究；探讨肿瘤血管生成在肿瘤发生发展及侵袭转移中的作用机制，寻找抗肿瘤血管新生的生物学靶点等。

肿瘤生物学治疗方法研究：通过建立肿瘤动物模型、基因工程等方法探讨外源性因素、基因工程产物对肿瘤实验性治疗效果，并进行药理学、毒理学及药代动力学的研究，评价实验性治疗效果等研究。

肿瘤流行病学研究：开展以全人群的肿瘤发病、死亡监测，肿瘤病因学、流行病学、肿瘤生态学、社区人群肿瘤防治、筛查和高危人群干预等方面的研究。

其它基础医学与转化医学研究：开展微生物感染与检测、发育生物学、生殖医学、变态反应性疾病等方面的基础研究与转化应用研究。